Gynekologie je nosným oborem činnosti GynCentra. Ambulantní péče je zajišťována na čtyřech místech v různých částech Prahy.
Lůžková část zdravotnického zařízení je v Praze 9 – Hloubětín.
V GynCentru se provádí více než 100 velkých operací (prováděných v celkové anestezii) měsíčně a cca 130 malých operačních výkonů. K přednostem společnosti patří mimořádně vysoké procento zákroků (90-95%) prováděných laparoskopicky, tedy technikou, která je vůči pacientkám velmi šetrná a zásadním způsobem zkracuje dobu pracovní neschopnosti.
Mimořádnou pozornost zasluhuje tzv. myolýza, nová operační technologie odstranění nezhoubných nádorů dělohy, umožňující otěhotnění i po takto závažném operačním zákroku. Pro těhotné pacientky zajišťujeme ultrazvukovou diagnostiku vrozených vývojových vad i např. fotografické snímky plodu pomocí špičkové 4D ultrazvukové metody.